Misi adalah rumusan umum mengenai upaya-upaya yangakan dilaksanakan untuk mewujudkan visi. Misi berfungsi sebagaipemersatu gerak, langkah dan tindakan nyata bagi segenapkomponen penyelenggara pemerintahan tanpa mengabaikanmandat yang diberikannya.
Adapun Misi Pemerintah Desa Pecuk adalah sebagai berikut;
Mewujudkan dan mengembangkan kegiatan keagamaan untukmenambah keimanan dan ketaqwaan kepada Tuhan YangMaha Esa.
Mewujudkan dan mendorong terjadinya usaha-usahakerukunan antar dan intern warga masyarakat yangdisebabkan karena adanya perbedaan agama,keyakinan,organisasi, dan lainnya dalam suasana saling menghargai danmenghormati.
Membangun dan meningkatkan hasil pertanian dengan jalanpenataan pengairan, perbaikan jalan sawah / jalan usaha tani,pemupukan, dan pola tanam yang baik.
Menata Pemerintahan Desa Pecuk yang kompak danbertanggung jawab dalam mengemban amanat masyarakat.
Meningkatkan pelayanan masyarakat secara terpadu danserius.
Mencari dan menambah debit air untuk mencukupi kebutuhanpertanian.
Menumbuh kembangkan Kelompok Tani dan GabunganKelompok Tani serta bekerja sama denga HIPPA untukmemfasilitasi kebutuhan Petani.
Menumbuhkembangkan usaha kecil dan menengah.
Membangun dan mendorong majunya bidang pendidikan baikformal maupun informal yang mudah diakses dan dinikmatiseluruh warga masyarakat tanpa terkecuali yang mampumenghasilkan insan intelektual, inovatif dan enterpreneur(wirausahawan).
Membangun dan mendorong usaha-usaha untukpengembangan dan optimalisasi sektor pertanian, perkebunan,peternakan, dan perikanan, baik tahap produksi maupuntahap pengolahan hasilnya.